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双峰驼常规抗体与重链抗体免疫谱的比较分析

作者:王乃慧   来源:内蒙古骆驼研究院  已浏览【】次  文字:【】【】【

    与经典抗体相比,骆驼重链抗体(hcabs)由于缺少轻链和重链的第一常数域(ch1区),体积较小。hcabs(vhs)的可变区比常规抗体(vhs)更易溶解和稳定。即使如此简单的结构,它们仍然在抗原结合中发挥作用。尽管在过去的二十年中,人们对驼型hcabs进行了广泛的研究,但大多数研究都是基于低吞吐量序列分析,而对驼型hcabs的完整免疫反应谱(ir)进行分析和描述的报道还很有限。Xinyang Li等人发表在PLOS ONE上的文章,利用来自三只双峰驼的抗体重链可变区的下一代测序(ngs)产生的高通量数据,对免疫球蛋白全谱进行深入的比较分析。这些包括互补决定区3(cdr3)的长度和分布、突变率、抗体特征氨基酸、半胱氨酸(cys)密码子的分布和非经典vhhs的分析。我们发现cdr2的多样性高于其它亚区,vhhs的突变率高于vhs(p<0.05)。除了在vh和vhh克隆之间的氨基酸残基位置49/50/52处的替换,我们还观察到在第40/54/57/96/101处可能导致额外结构改变的其他替换。我们还发现,vh衍生的vhh克隆,称为非经典vhh克隆,约占所有克隆的8%。此外,只有5%-10%的克隆的trp>arg-aa在框架4的第一个位置替换所有类型的克隆。他们首次提出了一个比较完整的双峰驼抗体免疫系统的图片,包括常规抗体(ab)和hcabs,使用pcr和基于高通量ngs数据的in-silico分析。


图1 非经典VHH克隆的结果分析


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