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为单峰骆驼(Camelus dromedarius)构建两个全基因组辐射杂交板:5000 RAD和1

作者:王旭   来源:内蒙古骆驼研究院  已浏览【】次  文字:【】【】【

目前,骆驼科动物的基因组资源的可用性非常有限。来自分子和细胞生物学研究所和新西伯利亚国立大学的波利娜·L·佩雷尔曼等人描述了为骆驼camelus dromedarius构建一套两个辐射杂交rh面板5000rad和15000rad的过程,作为全世界骆驼基因组研究人员的永久遗传资源。在5000rad群体中,共收集到245个雌骆驼-仓鼠辐射杂种克隆,其中186个被筛选出来,44个定制标记位点分布在骆驼基因组中。93个杂交组合的总平均保留频率rf为47.7%。在15000rad平板上,收集了238个雄性仓鼠辐射杂种克隆,其中93个用44个PCR标记进行了检测。最终90个克隆的平均rf为39.9%。这个15000rad面板是主5000rad面板的一个重要的高分辨率补充,也是解决复杂基因组区域不可或缺的工具。这种珍贵的骆驼rh基因资源有望为构建高分辨率骆驼基因组图谱提供帮助。rh基因板的构建是迈向染色体水平参考质量基因组组装的重要一步,这对于推进骆驼类基因组学和定制基因组工具的开发至关重要。

 

图1 基于供体基因组保留的186个辐射杂种5000rad)的频率分布

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