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李亦学

作者:内蒙古骆驼研究院   来源:内蒙古骆驼研究院  已浏览【】次  文字:【】【】【

             

李亦学 上海生物信息学会理事长,中国生物物理学会生物信息学专业委员会副主任委员,中国生物化学学会分子系统生物学学会秘书长。曾任国家“十五”863计划生物和现代农业领域生物信息技术主题专家组长,国家“十一五”863计划生物医药领域专家组专家。国际合作方面,与国际同行建立了广泛合作关系,特别是和韩、日生物信息学中心(KOBIC,DDBJ)合作的中日韩生物信息学年度培训班已连续成功地举行6届。还是国际生物信息研讨会(IBW)和亚太地区基因组信息学大会(GIW)的指导委员会成员,被日、韩、新、印、澳、新西兰等国和港台地区的生物信息学联合会组织推举为2010年轮值主席。还担任一些国际期刊BMC Bioinfor、J Integrated Omics副主编及J Theor Biol编委。近五年共发表学术论文60多篇,包括Scinece,Nature Genetics,Nature Biotechnology,Oncogene,PNAS,Bioinformatics等,论文总影响因子达200点以上,被应用400多次。共申请发明专利8项,获得软件著作权15项。

主持或参加科研项目及人才计划项目情况:

1、2006年-2010年承担了“模式生物与细胞等功能系统的系统生物学研究”国家蛋白质科学重大科学研究计划专项项目(项目号:2006CB910700),担任项目首席科学家,项目总中经费2460万元。项目已顺利通过了2010年的项目验收,在2006年当年立项的34个专项项目验收中评价为“优”,排名第四;

2、2011年承担了 “代谢生理活动与病理过程中信号转导网络的系统生物学研究” 国家蛋白质科学重大科学研究计划专项项目(项目号:2011CB910200),担任项目首席科学家,项目中经费2500万元。项目已顺利完成和通过了2012年的中期项目评估;

近五年来发表的相关论文:

1. Zhen Wang, Guohui Ding, et.al., Yixue Li*,He Meng*, 2012,Genome sequences of wild and domestic bactrian camels, Online published by Nature Communications.

2. Guangyong Zheng, Qi Liu, Guohui Ding, Chaochun Wei and Yixue Li*,2012,Towards Biological Characters of Interactions between Transcription Factors and their DNA Targets in Mammals,accepted by BMC Genomics.

3. Li, Huaixing, Gan, Wei, Lu, Ling, Dong, Xiao, Han, Xueyao, Hu, Cheng, Yang, Zhen, Sun, Liang, Bao, Wei; Li, Pengtao, He, Meian, Sun, Liangdan, Wang, Yiqin, Zhu, Jingwen, Ning, Qianqian, Tang, Yong, Zhang, Rong, Wen, Jie, Wang, Di, Zhu, Xilin, Guo, Kunquan, Zuo, Xianbo, Guo, Xiaohui, Yang, Handong, Zhou, Xianghai, Consortium, DIAGRAM, Consortium, AGEN-T2D, Zhang, Xuejun, Qi, Lu, Loos, Ruth, Hu, Frank, Wu, Tangchun, Liu, Ying, Liu, Liegang,Yang, Ze, Hu, Renming, Jia, Weiping, Ji, Linong, Yixue Li*, Xu Lin*, 2012, A Genome-Wide Association Study Identifies GRK5 and RASGRP1 as Type 2 Diabetes Loci in Chinese Hans, accpted by Diabetes.

4. Liang Sun, Yu Yu, Tao Huang, Peng An, Danxia Yu, Zhijie Yu, Huaixing Li, Hongguang Sheng, Lu Cai, Jun Xue, Miao Jing, Yixue Li*, Xu Lin*, Fudi Wang*, 2012, Associations between Ionomic Profile and Metabolic Abnormalities in Human Population, online published by Plos One.

5. Hui Yu, Huayong Xu, Lu Xie,Yuanyuan Li, Yixue Li*, 2012, Combinatorial network of transcriptional regulation and microRNA regulation in human cancer, accepted by BMC Molecular Systems Biology.

6. Liyun Yuan, Guohui Ding, Y. Eugene Chen , Zhe Chen, Yixue Li*, 2012, A novel strategy for deciphering dynamic conservation of gene expression relationship, accepted by Journal of Molecular Cell Biology.

7. Dong X, Zhong T, Xu T, Xia Y, Li B, Li C, Ding GH*, Li YX*. Evaluating coverage of exons by HapMap SNPs. Genomics. doi:pii: S0888-7543(12)00188-7. 10.1016 (2012).

8. Yan ji, Yixiang Shi, Chuan Wang, Yixue Li*, Meta genome-wide network from functional linkages of genes in human gut microbial ecosystems, 2012, accpted by Protein Peptide Letter. 

9. Yan Ji, Yixiang Shi, Guohui Ding, Yixue Li*, A new strategy for better genome assembly from very short reads, BMC Bioinformatics, 12:493 (2011)

10. Lu-Lu Zheng, Shen Niu, Pei Hao, KaiYan Feng, Yu-Dong Cai*, Yixue Li*Prediction of Protein Modification Sites of Pyrrolidone Carboxylic Acid Using mRMR Feature Selection and AnalysisPlos One, Vol. 6, Issue 12, e28221(2011)

11. Zhen Wang, Guohui Ding, Ludwig Geistlinger, Li Hong, Lei Liu, Rong Zeng*, Yoshio Tateno*, Yixue Li*. Evolution of protein phosphorylation for distinct functional modules in vertebrate genomMol Biol Evol , 28 (3): 1131-1140(2011)

12. Hao Ye, et.al., Yixue Li*, HIT: linking herbal active ingredients to targets. Nucleic Acids Res , 0305-1048(2011).

13. Zhong, Y. et al., Yixue Li*, Comparative proteogenomic analysis of the Leptospira interrogans virulence-attenuated strain IPAV against the pathogenic strain 56601. Cell Res 21, 1210-29 (2011).

14. Ying He, Yixue Li, et.al., dbDEPC 2.0: updated database of differentially expressed proteins in human cancers. Accepted by Nucleic Acids Res, (2011).

近五年来出版的相关书籍:

1.《生物信息学》主编 李霞,副主编 李亦学、廖飞。人民卫生出版社 2010,页数:478页, 16开,北京。(卫生部规划全国高等学校8年制和7年制临床医学专业用专业教材, ISBN:9787117129381)

2.《Understanding Bioinformatics》李亦学 郝沛主译,,[英]Marketa Zvelebil著。《理解生物信息学》,即将由科学出版社出版,576页

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